细胞数的统计 - Githubissues

xinehc / args_oap

ARGs-OAP: Online Analysis Pipeline for Antibiotic Resistance Genes Detection from Metagenomic Data Using an Integrated Structured ARG Database

MIT License

43 stars 11 forks source link

细胞数的统计 #75

Open GengY-sdu opened 2 weeks ago

GengY-sdu commented 2 weeks ago

您好，请问ARGs-OAP 3.0对于细胞数的统计是采用了和之前版本不同的方式嘛？在之前版本中我看还需要与16S rRNA 基因超可变区数据库进行比对，然后再使用CopyRighter数据库进行校正（上图）。在3.0版本我看只与ko30.fasta文件进行了比对（下图）。

期待您的回复，谢谢！

Snipaste_2024-11-08_11-11-48 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Snipaste_2024-11-08_11-11-19

xinehc commented 2 weeks ago

Cell numbers are currently estimated using 30 single-copy marker genes. The previous version used 16S copies + copyrighter for correction.