xuechunxu / DiTing

DiTing: A pipeline to infer and compare biogeochemical pathways in metagenomic data
GNU General Public License v3.0
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关于Diting配置完成之后运行,数据库自动下载安装的问题 #18

Closed ZhangMin-123 closed 6 days ago

ZhangMin-123 commented 2 years ago

你好,我按照github上的说明安装了Diting,使用时发现Check database环节,提示没有检测到KEGG数据库,然后开始了自动下载。请问可以下载到kegg数据吗?

ZhangMin-123 commented 2 years ago

kegg数据库现在收费了啊,能正常下载到吗

SilentGene commented 2 years ago

你好,我们使用的是kofam的数据库。你也可以手动下载并配置数据库,方法见我们的说明文档: https://github.com/xuechunxu/DiTing#step-2-download-databases

谢谢

ZhangMin-123 commented 2 years ago

现已跑通,谢谢大神,感谢回复

--------------原始邮件-------------- 发件人:"Heyu Lin @.>; 发送时间:2022年9月23日(星期五) 晚上9:44 收件人:"xuechunxu/DiTing" @.>; 抄送:"ZhangMin-123 @.>;"Author @.>; 主题:Re: [xuechunxu/DiTing] 关于Diting配置完成之后运行,数据库自动下载安装的问题 (Issue #18)

你好,我们使用的是kofam的数据库。你也可以手动下载并配置数据库,方法见我们的说明文档: https://github.com/xuechunxu/DiTing#step-2-download-databases

谢谢

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