В параметрах яндекс.карт есть state.margin, который устанавливает отступы от краёв, таким образом при показе нескольких маркеров сильно удалённых друг от друга они не будут выходить за края карты, но видимо компонент карты не может принимать в себя настройки map.margin.Manager, поэтому используя :show-all-markers="true" получается такая картина https://yadi.sk/i/Y6vS5LOVcSUV_A
В параметрах яндекс.карт есть state.margin, который устанавливает отступы от краёв, таким образом при показе нескольких маркеров сильно удалённых друг от друга они не будут выходить за края карты, но видимо компонент карты не может принимать в себя настройки map.margin.Manager, поэтому используя :show-all-markers="true" получается такая картина https://yadi.sk/i/Y6vS5LOVcSUV_A
https://yandex.ru/dev/maps/jsapi/doc/2.1/ref/reference/Map.html#Map__param-state.margin