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yychenleslie / SoftMatterDiscuss

软物质交流，讨论。
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如何使用VMD选择特定粒子，生成视频？ #9

Open HuangJiaLian opened 4 years ago

HuangJiaLian commented 4 years ago

快捷键 r t s : Rotation(Mouse), Translation(Hand), and Saling().

HuangJiaLian commented 3 years ago

Drawing Method: CPK， 材质 AOShiny 1 70 0.3 70 按照原子序号选择氧原子: index 4 62 按照原子序号选择水分子: within 1.5 of index 4 62 快捷键1标记/取消标记原子 within 1.5 of index 4 62添加氢键的显示氢键的标准3.5 30 4 窗口大小设置display resize 500 500 选择除去刚刚选择的那两个水分子 not within 1.5 of index 4 62

HuangJiaLian commented 3 years ago

以氧原子ID选择两个水分子:

显示两个水分子之间的氢键:

显示不是这两个水分子的背景水分子，修改一下材质，使其像背景一样，如这里使用的Glass1材质:

导出gif或者视频:

HuangJiaLian commented 3 years ago