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yyoshiaki / ikra

RNAseq pipeline centered on Salmon
https://doi.org/10.5281/zenodo.4718200
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27 stars 20 forks source link

Update ikra.sh #63

Closed yuto1352 closed 3 years ago

yuto1352 commented 3 years ago

udockerのSRA_TOOLKIT_IMAGE, FASTQC_IMAGE, MULTIQC_IMAGE, TRIMGALORE_IMAGE, SALMON_IMAGEを更新。 688行目の-- type quasiを削除。

yyoshiaki commented 3 years ago

テスト通りました！ Document(Readme)もバージョン更新してもらえますか？

HandaiMedStudent commented 3 years ago

梅津くんの方はバージョンアップがメインなのですが、readmeのどのあたりを更新すればいいのでしょうか？

yyoshiaki commented 3 years ago

https://github.com/yyoshiaki/ikra#version-of-each-tool

HandaiMedStudent commented 3 years ago

なるほど、ありがとうございます。