zerebom / paper-books

@zerebom が読んだ技術書、論文をまとめています。推薦システム系が多いです。
https://github.com/zerebom/paper-books/issues
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3D Kidneys and Kidney Tumor Semantic Segmentation using Boundary-Aware Networks #9

Open zerebom opened 5 years ago

zerebom commented 5 years ago

src: https://arxiv.org/abs/1909.06684

腎臓のDice score:0.9742 腎臓がんのDice score:0.8103 全体:0.8923と高い精度を出している。

zerebom commented 4 years ago

Abstract

Kits19のデータセットを使って、腎臓がんの自動識別をEncoder-Decoderモデルで行った論文。

従来のEncoder-Decorder機構にプラスして、境界面を特に注目するBoundary-Streamをネットワークに追加した。

Introduction

Architecture

2018年の腎臓がんの死者は延べ175,000人もいる。
現在の腎臓がんに対する手術は腎臓を全て除去するRN(Radical Nephrectomy)と、 癌になっている部分だけを取り除くPN(Partial Nephrectomy)がある。
癌の早期発見をすることができれば、手術を軽いPNだけですませることができるようになる。

高い専門技術が必要かつ、ミスが起こりやすい癌の識別という作業をNNによって代替できれば、 死者も医者の負担も減らすことができる。

Methods

image

Architecture

3x176x176x176のCT画像を入力し、学習する。 最初は16のフィルターを持つ3x3x3の3dConvに渡す。

Loss Functions

ResidualBlock

Implementation Details and Dataset【重要】

Data processing

[-1024,1024]->を1000分の1にして[-1,1]にする。そこから外れたものは削る specingは1x1x1mmにする。 cropは176x176x176にする。

Implementation details

Pytorch 0.8は cropping region was centered on the kidney tumor 0.1は任意のForeground 0.1はBackground

8x NVIDIA Tesla V100 G16

Results