search

zhanxw / rvtests

Rare variant test software for next generation sequencing data
131 stars 41 forks source link

gsl: fsolver.c:126: ERROR: endpoints do not enclose a minimum #32

Closed chesi closed 7 years ago

chesi commented 7 years ago

Hi, I get this error: gsl: fsolver.c:126: ERROR: endpoints do not enclose a minimum when running MEN on chr22 (but chrX works).

My command:

rvtest --inVcf "/mnt/isilon/grant_lab/imputation_BMDCS_ALL_1KGv3/chr22.imputed.poly.vcf.gz" --out "BMDCS_EUR_1KGP3_imputation_BMI_INV_MEN_chr22" --pheno "/mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/BMDCS_EUR_1KG_MALE_pheno.ped" --pheno-name "BMI_INV" --dosage "DS" --meta "score" --kinship "/mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/kinship_matrix/kinship_matrix_BMDCS_EUR_1KG.kinship"

The same analysis works on FEMALES and ALL, with the same kinship matrix. Can you please help?

Thanks! log.txt

zhanxw commented 7 years ago

Except chr22, does MALE fail on other chromosome?

chesi commented 7 years ago

Yes on all the autosomes. Thanks! A.

On Jun 6, 2017, at 12:00 PM, zhanxw notifications@github.com wrote:

Except chr22, does MALE fail on other chromosome?

— You are receiving this because you authored the thread. Reply to this email directly, view it on GitHub, or mute the thread.

chesi commented 7 years ago

Actually, the command for the X chr is different than that for the autosomes:

!/bin/bash

source ~/.bashrc panel="1KGP3" i=$1 ancestry="EUR" trait="BMI_INV" sex="MEN"

rvtest --inVcf /mnt/isilon/grant_lab/imputation_BMDCS_ALL_1KGv3/chr${i}.imputed.poly.vcf.gz \ --pheno /mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/BMDCS_EUR_1KG_MALE_pheno.ped \ --pheno-name ${trait} \ --meta score \ --xHemiKinship /mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/kinship_matrix/kinship_matrix_BMDCS_EUR1KG.xHemi.kinship \ --dosage DS \ --out BMDCS${ancestry}_${panel}imputation${trait}_${sex}_chr${i}

On Jun 6, 2017, at 12:00 PM, zhanxw notifications@github.com wrote:

Except chr22, does MALE fail on other chromosome?

— You are receiving this because you authored the thread. Reply to this email directly, view it on GitHub, or mute the thread.

zhanxw commented 7 years ago

I added debugging features for RVTESTS in: http://zhanxw.com/rvtests/experimental/rvtests-20170609-9aef1f-linux64-static.tar.gz

Can you please download, unpack and run it on the failed chromosomes (e.g. chr22) using:

FASTLMM_DEBUG=1 rvtest --inVcf "/mnt/isilon/grant_lab/imputation_BMDCS_ALL_1KGv3/chr22.imputed.poly.vcf.gz" --out "BMDCS_EUR_1KGP3_imputation_BMI_INV_MEN_chr22" --pheno "/mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/BMDCS_EUR_1KG_MALE_pheno.ped" --pheno-name "BMI_INV" --dosage "DS" --meta "score" --kinship "/mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/kinship_matrix/kinship_matrix_BMDCS_EUR_1KG.kinship"

Please paste outputs here. The outputs may be able to help me understand the problem better. Thanks.

chesi commented 7 years ago

Hi, I attach the output in a text file. Thanks! Alessandra

On Jun 9, 2017, at 5:01 PM, zhanxw notifications@github.com wrote:

I added debugging features for RVTESTS in: http://zhanxw.com/rvtests/experimental/rvtests-20170609-9aef1f-linux64-static.tar.gz http://zhanxw.com/rvtests/experimental/rvtests-20170609-9aef1f-linux64-static.tar.gz Can you please download it, unpack it and run on the failed chromosomes (e.g. chr22) using:

FASTLMM_DEBUG=1 rvtest --inVcf "/mnt/isilon/grant_lab/imputation_BMDCS_ALL_1KGv3/chr22.imputed.poly.vcf.gz" --out "BMDCS_EUR_1KGP3_imputation_BMI_INV_MEN_chr22" --pheno "/mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/BMDCS_EUR_1KG_MALE_pheno.ped" --pheno-name "BMI_INV" --dosage "DS" --meta "score" --kinship "/mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/kinship_matrix/kinship_matrix_BMDCS_EUR_1KG.kinship"

Please paste outputs here. The outputs may be able to help me understand the problem better. Thanks.

— You are receiving this because you authored the thread. Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/zhanxw/rvtests/issues/32#issuecomment-307498766, or mute the thread https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AMLKUOAMf8Ufmu6j0cZhT82wjxrspPJ1ks5sCbKagaJpZM4NoEpf.

The following parameters are available. Ones with "[]" are in effect:

Available Options Basic Input/Output: --inVcf [/mnt/isilon/grant_lab/imputation_BMDCS_ALL_1KGv3/chr22.imputed.poly.vcf.gz] --out [BMDCS_EUR_1KGP3_imputation_BMI_INV_MEN_chr22] --outputRaw Specify Covariate: --covar [], --covar-name [], --sex Specify Phenotype: --pheno [/mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/BMDCS_EUR_1KG_MALE_pheno.ped] --inverseNormal, --useResidualAsPhenotype, --mpheno [] --pheno-name [BMI_INV], --qtl, --multiplePheno [] Specify Genotype: --dosage [DS], --multipleAllele Chromosome X Options: --xLabel [], --xParRegion [] People Filter: --peopleIncludeID [], --peopleIncludeFile [] --peopleExcludeID [], --peopleExcludeFile [] Site Filter: --rangeList [], --rangeFile [], --siteFile [] --siteDepthMin [], --siteDepthMax [], --siteMACMin [] --annoType [] Genotype Filter: --indvDepthMin [], --indvDepthMax [], --indvQualMin [] Association Model: --single [], --burden [], --vt [], --kernel [] --meta [score] Family-based Models: --kinship [/mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/kinship_matrix/kinship_matrix_BMDCS_EUR_1KG.kinship] --xHemiKinship [], --kinshipEigen [] --xHemiKinshipEigen [], --boltPlink [] --boltPlinkNoCheck Grouping Unit : --geneFile [], --gene [], --setList [], --setFile [] --set [] Frequency Cutoff: --freqUpper [], --freqLower [] Missing Data: --impute [], --imputePheno, --imputeCov Conditional Analysis: --condition [] Auxiliary Functions: --noweb, --hide-covar, --numThread [], --help

Effective Options --inVcf /mnt/isilon/grant_lab/imputation_BMDCS_ALL_1KGv3/chr22.imputed.poly.vcf.gz --out BMDCS_EUR_1KGP3_imputation_BMI_INV_MEN_chr22 --pheno /mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/BMDCS_EUR_1KG_MALE_pheno.ped --pheno-name BMI_INV --dosage DS --meta score --kinship /mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/kinship_matrix/kinship_matrix_BMDCS_EUR_1KG.kinship

[INFO] Program version: 20170418 [INFO] Analysis started at: Mon Jun 12 12:50:27 2017 [INFO] Loaded [ 1833 ] samples from VCF files strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Missing or invalid phenotype type, skipping line 2 [ 0 7315081013_R01C01 0 0 NA NA NA ] ... strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Missing or invalid phenotype type, skipping line 3 [ 0 7315081013_R02C01 0 0 NA NA NA ] ... strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Missing or invalid phenotype type, skipping line 4 [ 0 7315081013_R03C01 0 0 2 NA NA ] ... strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Missing or invalid phenotype type, skipping line 5 [ 0 7315081013_R04C01 0 0 2 NA NA ] ... strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Missing or invalid phenotype type, skipping line 6 [ 0 7315081013_R05C01 0 0 NA NA NA ] ... strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Missing or invalid phenotype type, skipping line 7 [ 0 7315081013_R06C01 0 0 NA NA NA ] ... strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Missing or invalid phenotype type, skipping line 8 [ 0 7315081013_R07C01 0 0 NA NA NA ] ... strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Missing or invalid phenotype type, skipping line 9 [ 0 7315081013_R08C01 0 0 NA NA NA ] ... strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Missing or invalid phenotype type, skipping line 12 [ 0 7315081016_R03C01 0 0 2 NA NA ] ... strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Missing or invalid phenotype type, skipping line 13 [ 0 7315081016_R04C01 0 0 NA NA NA ] ... strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument strtod: Invalid argument [WARN] Skip: Additional [ 1639 ] lines have missing or invalid phenotype type [INFO] Loaded [ 184 ] sample pheontypes [WARN] Total [ 1649 ] samples are dropped from VCF file due to missing phenotype. [WARN] Drop sample [ 7315081013_R01C01 ] from VCF file due to missing phenotype [WARN] Drop sample [ 7315081013_R02C01 ] from VCF file due to missing phenotype [WARN] Drop sample [ 7315081013_R03C01 ] from VCF file due to missing phenotype [WARN] Drop sample [ 7315081013_R04C01 ] from VCF file due to missing phenotype [WARN] Drop sample [ 7315081013_R05C01 ] from VCF file due to missing phenotype [WARN] Drop sample [ 7315081013_R06C01 ] from VCF file due to missing phenotype [WARN] Drop sample [ 7315081013_R07C01 ] from VCF file due to missing phenotype [WARN] Drop sample [ 7315081013_R08C01 ] from VCF file due to missing phenotype [WARN] Drop sample [ 7315081016_R03C01 ] from VCF file due to missing phenotype [WARN] Drop sample [ 7315081016_R04C01 ] from VCF file due to missing phenotype [WARN] Skip outputting additional [ 1639 ] samples due to missing phenotype. [INFO] Loaded 184 male, 0 female and 0 sex-unknonw samples from /mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/BMDCS_EUR_1KG_MALE_pheno.ped [INFO] Analysis begins with [ 184 ] samples... [INFO] Family-based model specified. Loading kinship file... [INFO] DONE: Loaded kinship file [ /mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/kinship_matrix/kinship_matrix_BMDCS_EUR_1KG.kinship ] successfully in [ 0.1 ] seconds. [INFO] DONE: Spectral decomposition of the kinship matrix succeeded in [ 0.0 ] seconds. [INFO] Kinship file [ /mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/kinship_matrix/kinship_matrix_BMDCS_EUR_1KG.xHemi.kinship ] detected and will be used for for X chromosome analysis [INFO] Kinship eigen-decomposition file [ .xHemi.eigen ] detected and will be used for for X chromosome analysis [INFO] DONE: Loaded kinship file [ /mnt/isilon/grant_lab/chesia/analyses/GIANT_anthropometrics/analysis/ALL_1KG/kinship_matrix/kinship_matrix_BMDCS_EUR_1KG.xHemi.kinship ] successfully in [ 0.1 ] seconds. [INFO] DONE: Loaded spectral decomposition result file [ .xHemi.eigen ] succeeded in [ 0.1 ] seconds. [INFO] Impute missing genotype to mean (by default) [INFO] Use dosage genotype from VCF flag DS. [INFO] Analysis started 0 delta=4.53999e-05 ll=-260.744062 beta(0)=0.003606 sigma2=1.000892 1 delta=5.54516e-05 ll=-260.744050 beta(0)=0.003606 sigma2=1.000881 2 delta=6.77287e-05 ll=-260.744041 beta(0)=0.003606 sigma2=1.000869 3 delta=8.27241e-05 ll=-260.744045 beta(0)=0.003606 sigma2=1.000854 4 delta=0.000101039 ll=-260.744038 beta(0)=0.003606 sigma2=1.000835 5 delta=0.00012341 ll=-260.744031 beta(0)=0.003606 sigma2=1.000812 6 delta=0.000150733 ll=-260.744018 beta(0)=0.003606 sigma2=1.000785 7 delta=0.000184106 ll=-260.743996 beta(0)=0.003606 sigma2=1.000751 8 delta=0.000224867 ll=-260.743982 beta(0)=0.003606 sigma2=1.000709 9 delta=0.000274654 ll=-260.743962 beta(0)=0.003606 sigma2=1.000659 10 delta=0.000335463 ll=-260.743934 beta(0)=0.003605 sigma2=1.000597 11 delta=0.000409735 ll=-260.743906 beta(0)=0.003605 sigma2=1.000522 12 delta=0.000500451 ll=-260.743860 beta(0)=0.003605 sigma2=1.000430 13 delta=0.000611253 ll=-260.743817 beta(0)=0.003604 sigma2=1.000317 14 delta=0.000746586 ll=-260.743756 beta(0)=0.003604 sigma2=1.000180 15 delta=0.000911882 ll=-260.743695 beta(0)=0.003603 sigma2=1.000012 16 delta=0.00111378 ll=-260.743609 beta(0)=0.003602 sigma2=0.999808 17 delta=0.00136037 ll=-260.743490 beta(0)=0.003601 sigma2=0.999558 18 delta=0.00166156 ll=-260.743372 beta(0)=0.003600 sigma2=0.999253 19 delta=0.00202943 ll=-260.743212 beta(0)=0.003599 sigma2=0.998880 20 delta=0.00247875 ll=-260.743026 beta(0)=0.003597 sigma2=0.998426 21 delta=0.00302755 ll=-260.742793 beta(0)=0.003595 sigma2=0.997872 22 delta=0.00369786 ll=-260.742510 beta(0)=0.003592 sigma2=0.997195 23 delta=0.00451658 ll=-260.742161 beta(0)=0.003589 sigma2=0.996371 24 delta=0.00551656 ll=-260.741745 beta(0)=0.003586 sigma2=0.995365 25 delta=0.00673795 ll=-260.741232 beta(0)=0.003581 sigma2=0.994140 26 delta=0.00822975 ll=-260.740614 beta(0)=0.003575 sigma2=0.992647 27 delta=0.0100518 ll=-260.739857 beta(0)=0.003568 sigma2=0.990830 28 delta=0.0122773 ll=-260.738933 beta(0)=0.003560 sigma2=0.988620 29 delta=0.0149956 ll=-260.737821 beta(0)=0.003550 sigma2=0.985935 30 delta=0.0183156 ll=-260.736482 beta(0)=0.003538 sigma2=0.982674 31 delta=0.0223708 ll=-260.734832 beta(0)=0.003523 sigma2=0.978721 32 delta=0.0273237 ll=-260.732858 beta(0)=0.003505 sigma2=0.973935 33 delta=0.0333733 ll=-260.730473 beta(0)=0.003483 sigma2=0.968154 34 delta=0.0407622 ll=-260.727613 beta(0)=0.003456 sigma2=0.961186 35 delta=0.0497871 ll=-260.724194 beta(0)=0.003425 sigma2=0.952810 36 delta=0.0608101 ll=-260.720117 beta(0)=0.003387 sigma2=0.942778 37 delta=0.0742736 ll=-260.715284 beta(0)=0.003341 sigma2=0.930809 38 delta=0.090718 ll=-260.709593 beta(0)=0.003287 sigma2=0.916598 39 delta=0.110803 ll=-260.702912 beta(0)=0.003223 sigma2=0.899822 40 delta=0.135335 ll=-260.695194 beta(0)=0.003149 sigma2=0.880151 41 delta=0.165299 ll=-260.686323 beta(0)=0.003061 sigma2=0.857267 42 delta=0.201897 ll=-260.676269 beta(0)=0.002961 sigma2=0.830889 43 delta=0.246597 ll=-260.665005 beta(0)=0.002846 sigma2=0.800802 44 delta=0.301194 ll=-260.652615 beta(0)=0.002716 sigma2=0.766896 45 delta=0.367879 ll=-260.639188 beta(0)=0.002571 sigma2=0.729199 46 delta=0.449329 ll=-260.624914 beta(0)=0.002413 sigma2=0.687915 47 delta=0.548812 ll=-260.610047 beta(0)=0.002243 sigma2=0.643439 48 delta=0.67032 ll=-260.594870 beta(0)=0.002063 sigma2=0.596364 49 delta=0.818731 ll=-260.579727 beta(0)=0.001877 sigma2=0.547462 50 delta=1 ll=-260.564918 beta(0)=0.001689 sigma2=0.497639 51 delta=1.2214 ll=-260.550715 beta(0)=0.001502 sigma2=0.447871 52 delta=1.49182 ll=-260.537387 beta(0)=0.001321 sigma2=0.399133 53 delta=1.82212 ll=-260.525066 beta(0)=0.001149 sigma2=0.352316 54 delta=2.22554 ll=-260.513829 beta(0)=0.000990 sigma2=0.308175 55 delta=2.71828 ll=-260.503771 beta(0)=0.000845 sigma2=0.267280 56 delta=3.32012 ll=-260.494833 beta(0)=0.000715 sigma2=0.230007 57 delta=4.0552 ll=-260.486974 beta(0)=0.000601 sigma2=0.196535 58 delta=4.95303 ll=-260.480123 beta(0)=0.000503 sigma2=0.166876 59 delta=6.04965 ll=-260.474245 beta(0)=0.000418 sigma2=0.140905 60 delta=7.38906 ll=-260.469172 beta(0)=0.000346 sigma2=0.118401 61 delta=9.02501 ll=-260.464838 beta(0)=0.000286 sigma2=0.099074 62 delta=11.0232 ll=-260.461175 beta(0)=0.000236 sigma2=0.082606 63 delta=13.4637 ll=-260.458073 beta(0)=0.000194 sigma2=0.068665 64 delta=16.4446 ll=-260.455458 beta(0)=0.000159 sigma2=0.056930 65 delta=20.0855 ll=-260.453323 beta(0)=0.000131 sigma2=0.047099 66 delta=24.5325 ll=-260.451477 beta(0)=0.000107 sigma2=0.038895 67 delta=29.9641 ll=-260.449986 beta(0)=0.000088 sigma2=0.032072 68 delta=36.5982 ll=-260.448710 beta(0)=0.000072 sigma2=0.026413 69 delta=44.7012 ll=-260.447703 beta(0)=0.000059 sigma2=0.021730 70 delta=54.5981 ll=-260.446831 beta(0)=0.000048 sigma2=0.017862 71 delta=66.6863 ll=-260.446156 beta(0)=0.000040 sigma2=0.014672 72 delta=81.4509 ll=-260.445570 beta(0)=0.000032 sigma2=0.012044 73 delta=99.4843 ll=-260.445089 beta(0)=0.000026 sigma2=0.009883 74 delta=121.51 ll=-260.444723 beta(0)=0.000022 sigma2=0.008106 75 delta=148.413 ll=-260.444328 beta(0)=0.000018 sigma2=0.006646 76 delta=181.272 ll=-260.444113 beta(0)=0.000014 sigma2=0.005448 77 delta=221.406 ll=-260.443903 beta(0)=0.000012 sigma2=0.004465 78 delta=270.426 ll=-260.443695 beta(0)=0.000010 sigma2=0.003659 79 delta=330.3 ll=-260.443569 beta(0)=0.000008 sigma2=0.002997 80 delta=403.429 ll=-260.443531 beta(0)=0.000006 sigma2=0.002455 81 delta=492.749 ll=-260.443384 beta(0)=0.000005 sigma2=0.002011 82 delta=601.845 ll=-260.443287 beta(0)=0.000004 sigma2=0.001647 83 delta=735.095 ll=-260.443213 beta(0)=0.000004 sigma2=0.001349 84 delta=897.847 ll=-260.443125 beta(0)=0.000003 sigma2=0.001105 85 delta=1096.63 ll=-260.443125 beta(0)=0.000002 sigma2=0.000905 86 delta=1339.43 ll=-260.443087 beta(0)=0.000002 sigma2=0.000741 87 delta=1635.98 ll=-260.443092 beta(0)=0.000002 sigma2=0.000607 88 delta=1998.2 ll=-260.443014 beta(0)=0.000001 sigma2=0.000497 89 delta=2440.6 ll=-260.442968 beta(0)=0.000001 sigma2=0.000407 90 delta=2980.96 ll=-260.442974 beta(0)=0.000001 sigma2=0.000333 91 delta=3640.95 ll=-260.442928 beta(0)=0.000001 sigma2=0.000273 92 delta=4447.07 ll=-260.442955 beta(0)=0.000001 sigma2=0.000223 93 delta=5431.66 ll=-260.442925 beta(0)=0.000000 sigma2=0.000183 94 delta=6634.24 ll=-260.442986 beta(0)=0.000000 sigma2=0.000150 95 delta=8103.08 ll=-260.442921 beta(0)=0.000000 sigma2=0.000123 96 delta=9897.13 ll=-260.442844 beta(0)=0.000000 sigma2=0.000100 97 delta=12088.4 ll=-260.442844 beta(0)=0.000000 sigma2=0.000082 98 delta=14764.8 ll=-260.442886 beta(0)=0.000000 sigma2=0.000067 99 delta=18033.7 ll=-260.443005 beta(0)=0.000000 sigma2=0.000055 100 delta=22026.5 ll=-260.442913 beta(0)=0.000000 sigma2=0.000045 gsl: fsolver.c:126: ERROR: endpoints do not enclose a minimum Default GSL error handler invoked.

zhanxw commented 7 years ago

Great. That's very helpful for debugging. I will get back to you.

zhanxw commented 7 years ago

Can you please try the link and see if it solves your problem? Thanks.

http://zhanxw.com/rvtests/experimental/rvtests-20170613-01e018-linux64-static.tar.gz

chesi commented 7 years ago

Hi, it worked! Thanks, Alessandra

On Jun 13, 2017, at 6:11 PM, zhanxw notifications@github.com wrote:

Can you please try the link and see if it solves your problem? Thanks.

http://zhanxw.com/rvtests/experimental/rvtests-20170613-01e018-linux64-static.tar.gz

— You are receiving this because you authored the thread. Reply to this email directly, view it on GitHub, or mute the thread.

zhanxw commented 7 years ago

Great to know that. Thanks.