zhouyunyan
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1 year ago total_counts这一步成功运行了吗？
周云燕 @.***
------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "zhouyunyan/PIGC" @.>; 发送时间: 2023年7月3日(星期一) 晚上9:43 @.>; @.***>; 主题: [zhouyunyan/PIGC] 在学习06_abundance过程中报错 (Issue #6)
周老师您好： 在学习您PIGC文章的pipeline时，进行到下边的步骤： total_counts=$(cat abundance/${SampleID}.counts | grep -v -w '^Geneid' | awk '{a+=$NF}END{print a}') awk -v "counts=$total_counts" '{if(NR>1){print $1"\t"10000001000$NF/($(NF-1)*counts)}else{print $1"\t"$NF}}' abundance/${SampleID}.counts > abundance/${SampleID}.fpkm.txt 出现报错：fatal: division by zero attempted 我觉得可能是其中（NF-1）可能等于0导致的。 请问如何解决该问题。 下边是counts结果的部分截图：
期待您的答复。
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ylei14
周老师您好： 在学习您PIGC文章的pipeline时，进行到下边的步骤： total_counts=$(cat abundance/${SampleID}.counts | grep -v -w '^Geneid' | awk '{a+=$NF}END{print a}') awk -v "counts=$total_counts" '{if(NR>1){print $1"\t"10000001000$NF/($(NF-1)*counts)}else{print $1"\t"$NF}}' abundance/${SampleID}.counts > abundance/${SampleID}.fpkm.txt 出现报错：fatal: division by zero attempted 我觉得可能是其中（NF-1）可能等于0导致的。 请问如何解决该问题。 下边是counts结果的部分截图：
期待您的答复。