zmactep / ig-pipeline

2 stars 0 forks source link

Удалять треш на концах сиквенсов #5

Open Feodorov opened 11 years ago

Feodorov commented 11 years ago

Может случиться, что на краях останутся адаптеры/праймеры. Можно либо использовать список праймеров/адаптеров, либо отрезать по error prediction (http://weka.wikispaces.com/Making+predictions) . Низкоприоритетно.

zmactep commented 11 years ago

Дополнительно надо отметить, что все, что можно отрезать по известным последовательностям/таблицам, всегда будет отрезано на предыдущих этапах. Так что тут нужно просто отбрасывать мусор.