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when run the annotation, I got a warning:
`WARNING: Your index file hg19_clinvar_20170130.txt.idx is out of date a
nd will not be used. ANNOVAR can still generate correct results without index file.…
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One word is not correct:
1000 Genomes Project (2012 April) annotations (obselete!) -> obsolete
url: https://github.com/WGLab/doc-ANNOVAR/blob/master/docs/user-guide/filter.md
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Realizar download dos seguintes datasets disponibilizados no software annovar:
- [x] gnomad_exome
- [x] abraom
- [x] mcap
- [x] revel
- [x] avsnp150
- [x] clinvar_20170905
- [x] gerp++elem
- […
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Able to do something like this would be nice
```
df.query('[col with space] < col')
```
I came across many external data files which have spaces in the column names. It would be nice to be able to d…
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Issue criada para documentar o passo-a-passo no desenvolvimento da rotina de processamento do dataset hg19_clinvar_20170905. Os passos a seguir serão realizados:
- [x] Exploração do dataset por mei…
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Issue criada para documentar o passo-a-passo no desenvolvimento da rotina de processamento do dataset hg19_mcap. Os passos a seguir serão realizados:
- [x] Exploração do dataset por meio de noteboo…
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## Version of Singularity:
2.4
### Expected behavior
Able to add files after running commands in `%post`
### Actual behavior
You can't add files after running commands in `%post` ([docs…
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Issue criada para documentar o passo-a-passo no desenvolvimento da rotina de processamento do dataset hg19_revel. Os passos a seguir serão realizados:
- [x] Exploração do dataset por meio de notebo…
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Issue criada para documentar o passo-a-passo no desenvolvimento da rotina de processamento do dataset hg19_abraom. Os passos a seguir serão realizados:
- [x] Exploração do dataset por meio de noteb…
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Hi could you give me an indication when the server for wANNOVAR is going to be up again? will it still be accessed from http://wannovar.wglab.org/
thank you for your assistance
Elena
elmav updated
5 years ago