Analiza podatkov s programom R, 2019/20

Repozitorij z gradivi pri predmetu APPR v študijskem letu 2019/20

• Shiny
• RStudio

Tematika

Izbrali si boste temo, s katero se bo vaš projekt ukvarjal. Tukaj boste napisali, kje ste dobili podatke, ter kakšen je vaš cilj.

Za projekt sem si izbral analizo zdravstvenih podjetji v Sloveniji. Analizo bom pripravil na podlagi podatkov iz Ajpesa in Erar-a. Osredotočil se bom na prihodke, izkaz poslovnega izida in bilanco stanja za leta 2015-2018. S spletne strani Erar pa bom pridobil podatke za prejemke iz javnih sredstev za leti 2017 in 2018. Podatke bom s spletnih strani izločil s pomočjo scraperja in jih uvozil v excel(iskal bom po davčni številki podjetja), iz Vzajemnine baze podatkov pa sem priodbil podatke o obsegu podjetja, vrsti zdravstvene dejavnosti in številu zaposlenih.

Pregled podatkov bo temeljil na lokaciji zdravstvenega izvajalca, vrsti izvajane zdravstvene dejavnosti, število zaposlenih, dobičku, prihodkih, razmerju med dobičkom in prejemkih iz javnih sredstev ter deleža prejemkov iz javnih sredstev v prihodkih.

Program

Glavni program in poročilo se nahajata v datoteki projekt.Rmd. Ko ga prevedemo, se izvedejo programi, ki ustrezajo drugi, tretji in četrti fazi projekta:

• obdelava, uvoz in čiščenje podatkov: uvoz/uvoz.r
• analiza in vizualizacija podatkov: vizualizacija/vizualizacija.r
• napredna analiza podatkov: analiza/analiza.r

Vnaprej pripravljene funkcije se nahajajo v datotekah v mapi lib/. Podatkovni viri so v mapi podatki/. Zemljevidi v obliki SHP, ki jih program pobere, se shranijo v mapo ../zemljevidi/ (torej izven mape projekta).

Potrebni paketi za R

Za zagon tega vzorca je potrebno namestiti sledeče pakete za R:

• knitr - za izdelovanje poročila
• rmarkdown - za prevajanje poročila v obliki RMarkdown
• shiny - za prikaz spletnega vmesnika
• DT - za prikaz interaktivne tabele
• rgdal - za uvoz zemljevidov
• rgeos - za podporo zemljevidom
• digest - za zgoščevalne funkcije (uporabljajo se za shranjevanje zemljevidov)
• readr - za branje podatkov
• rvest - za pobiranje spletnih strani
• tidyr - za preoblikovanje podatkov v obliko tidy data
• dplyr - za delo s podatki
• gsubfn - za delo z nizi (čiščenje podatkov)
• ggplot2 - za izrisovanje grafov
• mosaic - za pretvorbo zemljevidov v obliko za risanje z ggplot2
• maptools - za delo z zemljevidi
• extrafont - za pravilen prikaz šumnikov (neobvezno)

Binder

Zgornje povezave omogočajo poganjanje projekta na spletu z orodjem Binder. V ta namen je bila pripravljena slika za Docker, ki vsebuje večino paketov, ki jih boste potrebovali za svoj projekt.

Če se izkaže, da katerega od paketov, ki ji potrebujete, ni v sliki, lahko za sprotno namestitev poskrbite tako, da jih v datoteki install.R namestite z ukazom install.packages. Te datoteke (ali ukaza install.packages) ne vključujte v svoj program - gre samo za navodilo za Binder, katere pakete naj namesti pred poganjanjem vašega projekta.

Tako nameščanje paketov se bo izvedlo pred vsakim poganjanjem v Binderju. Če se izkaže, da je to preveč zamudno, lahko pripravite lastno sliko z želenimi paketi.

Če želite v Binderju delati z git, v datoteki gitconfig nastavite svoje ime in priimek ter e-poštni naslov (odkomentirajte vzorec in zamenjajte s svojimi podatki) - ob naslednjem zagonu bo mogoče delati commite. Te podatke lahko nastavite tudi z git config --global v konzoli (vendar bodo veljale le v trenutni seji).