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代谢网络模型构建和使用实操
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Tutorials-of-metabolic-modeling

关于我

长期从事代谢网络模型相关工作,以一作身份在国际期刊如PNAS(4篇)、MSB、NAR等发文10+篇(见个人主页),并受邀审稿(见Web of Science)。

关于你

具有微生物学和生物化学的知识储备,对代谢网络模型感兴趣,打算在未来研究中使用模型。建议提前阅读模型相关的经典文献以掌握一定基础知识,例如模型构建(Nat Protoc 2010)、流量平衡分析(Nat Biotechnol 2010)等。

关于本教程

将介绍细胞代谢网络模型的构建和使用的实际操作。

教程内容

将涉及基础、应用和进阶三部分:

需要用的软件和工具

请自行下载并安装以下软件和工具包:

注意 安装完毕后,每次使用本教程的时候都需要运行startme文件以加载COBRA工具包,或者自行输入initCobraToolbox进行加载。

其它

如果在使用过程中有任何问题,可以在Issues提出。

如对教程内容有任何建议,请与我联系(yuchen.scholar@gmail.com)。