长期从事代谢网络模型相关工作,以一作身份在国际期刊如PNAS(4篇)、MSB、NAR等发文10+篇(见个人主页),并受邀审稿(见Web of Science)。
具有微生物学和生物化学的知识储备,对代谢网络模型感兴趣,打算在未来研究中使用模型。建议提前阅读模型相关的经典文献以掌握一定基础知识,例如模型构建(Nat Protoc 2010)、流量平衡分析(Nat Biotechnol 2010)等。
将介绍细胞代谢网络模型的构建和使用的实际操作。
将涉及基础、应用和进阶三部分:
请自行下载并安装以下软件和工具包:
注意 安装完毕后,每次使用本教程的时候都需要运行startme文件以加载COBRA工具包,或者自行输入initCobraToolbox进行加载。
如果在使用过程中有任何问题,可以在Issues提出。
如对教程内容有任何建议,请与我联系(yuchen.scholar@gmail.com)。