Phydro merge into main

[fabern]

This is the discussion thread for planning the merge of the phydro branch into the main model.

TODO before the merge:

• [ ] publish rsofun documentation paper as is

TODO for the merge:

• [x] fix #220
• [ ] fix #218
• [ ] calibration: reduce redundancies in cost-functions and streamline two methods of 'GenSA' or 'BayesianTools'
• [ ] update rsofun::p_model_drivers with readRDS(file = here::here("data/p_model_drivers_newformat.rds")), as well as rsofun::p_model_drivers_vcmax25
  • [ ] recompute forcing, forcing_24h, forcing_daytime, forcing_3hrmax for the drivers
• [ ] switch handling of whc from a params_modl to a site parameter
  • [ ] e.g. in runread_pmodel_f.R that sends the multi-site data.frame to individual simualtions?
  • [ ] or alternatively remove it form par: here in R, here in C and here in F90.
• [ ] include "regression tests" into the test suites to detect alteration of results, e.g. extend current test by verifying results remain similar
• [ ] design and document a robust, user-friendly interface for the different model flags
• [ ] ...

Other suggestions:

• [ ] reduce interface complexity:
  • [ ] does run_pmodel_f_bysite() need to be an exported (and documented) function? Or will it anyway always be called from runread_pmodel_f, and we can thus keep it internal (and undocumented)?
  • [ ] remove argument parallel form the runread_pmodel_f() and runread_biomee_f() functions since it is equivalent with setting ncores = 1
  • [ ] ...

[stineb]

Mit diesem Merge sollten wir dann noch zuwarten. Die bisherige Strategie ist, erst das rsofun Dokumentations-Paper veröffentlichen, erst danach das hier. Das könnte aber noch dauern und wir können in Erwägung ziehen, den Merge vorzuziehen und die Dokumentation entsprechend anpassen. Allerdings wäre das eine grössere Anpassung und ich fürchte etwas, dass das mit enormem Zusatzaufwand verbunden wäre.

[fabern]

Ja, ich denke die vorgeschlagene Strategie ist okay zuerst das paper zu veröffentlichen.

Der PR-Thread hier dient einfach als gemeinsamen Notizblock und als sichtbares Signal für den phydro branch. Aus meiner Sicht spricht nichts dagegen, wenn dieser PR so lange im Draft Stadium bleibt wie der phydro branch.