inbo / alien-species-portal

Portal for alien and invasive species indicators
MIT License
0 stars 0 forks source link

Management page of Muntiacus reveesi #29

Open SanderDevisscher opened 1 year ago

SanderDevisscher commented 1 year ago
SanderDevisscher commented 1 year ago

dataprep progress see https://github.com/inbo/backoffice-wild-analyse/issues/865

SanderDevisscher commented 1 year ago

@bramdhondt hier vind je de muntjakken die opgenomen werden in het e-loket/autopsiedb. Merk op dat we ze voorzien hebben van een dummy INBO label (zie dit stuk code)

SanderDevisscher commented 1 year ago

Ook interessant om te weten is dat dit stuk code meldingen van afschot die in dit stuk niet te definiëren valt wegschrijft. bvb sika zit hier nog niet bij en zou als ze via het e-loket gemeld worden wegeschreven moeten worden. Hetgeen nog niet gebeurd is (laatste update 02/01/2023).

bramdhondt commented 1 year ago

Ok, goed zo. Ik zou het in het dashboard voorlopig houden op een figuur of tabel met aantal geschoten dieren per kalenderjaar.

SanderDevisscher commented 1 year ago

maw een grafiek met totaal aantal geschoten individuen ? Opgesplitst per gemeente/provincie? of enkel totaal ?

Het is relatief gemakkelijk om hier een kaartje op gemeente en provincie niveau aan toe te voegen (zie grofwildpagina). Ook doen ?

timadriaens commented 1 year ago

Ik zou dat precies wel doen, ja, omdat dat 1. informatiewaarde heeft 2. er een beetje hetzelfde uitziet als rosse stekelstaart. En van ondergrond idem zou ik zeggen, als er maar geen WBE afbakeningen opstaan...

bramdhondt commented 1 year ago

@SanderDevisscher - Als dit al voor andere soorten is uitgewerkt (bv. rosse stekelstaart, grofwild; zoals ik begrijp van @tim), kun je muntjak wat mij betreft zo veel als mogelijk op die leest schoeien. Er is geen specifiek aspect aan muntjak die voor een andere aanpak vraagt.

Merk op dat de verwerking van de e-loketgegevens ook in de muntjak-branch is/wordt uitgewerkt. Daar gaat het om meer à la carte verwerking (i.f.v. SV's, manuscripten...) : https://github.com/inbo/fis-projecten/blob/318_Muntjak/Exoten/muntjak/scripts/Muntjak_e-loket.Rmd .

SanderDevisscher commented 1 year ago

Het kan volgens mij geen kwaad om vaak terugkerende parlementaire en andere vragen in de mate van het mogelijke weer te geven op het exotenportaal, zodat wanneer er zo'n een vraag komt, verwezen kan worden naar het portaal. Dit kunnen we later nog uitwerken.

Dus samengevat:

@SanderDevisscher levert opgekuiste dataset aan obv muntjakken data uit eloket. M.a.w. drop unneeded columns. @mvarewyck moeten de datasets ook gesplitst worden in eco en geo ? voorlopig gaat dit slechts over een 50-tal dieren. Needed columns:

@mvarewyck werkt volgende items uit obv aangeleverde:

  1. Kaartje analoog met grofwild met totaal afschot per jaar per regio (gemeente/provincie)
  2. Line graph voor geselecteerde regio(s)
  3. Stacked barplot van het totaal aantal geschoten individuen per jaar opgesplitst per provincie

@bramdhondt @timadriaens @SanderDevisscher bekijken of er vaak terugkerende vragen zijn die eventueel ook gevisualiseerd kunnen worden obv e-loket data.

mvarewyck commented 1 year ago

@mvarewyck moeten de datasets ook gesplitst worden in eco en geo ?

@SanderDevisscher Dat lijkt me niet nodig

bramdhondt commented 1 year ago

@SanderDevisscher en @mvarewyck : ik geef mee dat de geografische coördinaten van geschoten muntjakken (toch zoals ik ze destijds aangeleverd kreeg) geen consistente format hadden (decimaalteken verschoven over een verschillend aantal posities). Ik werkte daarom een fix in in mijn script: lijnen 48-61. Zie maar of jullie op hetzelfde probleem botsen, en hoe die best wordt opgelost.

SanderDevisscher commented 1 year ago

Heb je de files eerst geopend in excel ?

Op do 4 mei 2023 10:18 schreef bramdhondt @.***>:

@SanderDevisscher https://github.com/SanderDevisscher en @mvarewyck https://github.com/mvarewyck : ik geef mee dat de geografische coördinaten van geschoten muntjakken (toch zoals ik ze destijds aangeleverd kreeg) geen consistente format hadden (decimaalteken verschoven over een verschillend aantal posities). Ik werkte daarom een fix in in mijn script: lijnen 48-61 https://github.com/inbo/fis-projecten/blob/318_Muntjak/Exoten/muntjak/scripts/Muntjak_e-loket.Rmd. Zie maar of jullie op hetzelfde probleem botsen, en hoe die best wordt opgelost.

— Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/inbo/alien-species-portal/issues/29#issuecomment-1534276556, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AEAAQOHX6BM3QGQQHXFYSTTXENQ4HANCNFSM56ZDT3ZQ . You are receiving this because you were mentioned.Message ID: @.***>

bramdhondt commented 1 year ago

@SanderDevisscher : neen, maar het heeft inderdaad te maken met de manier waarop ik de data inlaad.

Ruwe data in de csv : 1ste lijn = 7 getallen na de komma, 2de lijn = 8 getallen na de komma

afbeelding

Eenmaal ingelezen in R wordt dit: 1ste lijn = e+12, 2de lijn = e+13

afbeelding

En dan gaat het mis... Maar jullie doen dit ongetwijfeld beter. Dus no worries.

mvarewyck commented 1 year ago

@SanderDevisscher : neen, maar het heeft inderdaad te maken met de manier waarop ik de data inlaad.

Ruwe data in de csv : 1ste lijn = 7 getallen na de komma, 2de lijn = 8 getallen na de komma

afbeelding

Eenmaal ingelezen in R wordt dit: 1ste lijn = e+12, 2de lijn = e+13

afbeelding

En dan gaat het mis... Maar jullie doen dit ongetwijfeld beter. Dus no worries.

Welke functie gebruik je om de data in te laden? Iets als read.table(file, sep = ";", dec = ",") zou moeten werken

bramdhondt commented 1 year ago

@mvarewyck - Ik lees in als read_delim("./Muntjak_DMOGG.csv", delim = ";"). Inderdaad, read.table behoudt de oorspronkelijke waarden beter.

afbeelding

Dank! Zo heb ik jullie issue toch maar even gekaapt :-)

mvarewyck commented 8 months ago

@SanderDevisscher Zijn deze data al ergens beschikbaar?

SanderDevisscher commented 8 months ago

Not yet, ik maak tijd om dit te voorzien.

SanderDevisscher commented 8 months ago

Ik heb wel een ongekuiste versie waar de nodige kolommen reeds in voorkomen (zie onder) maar ik ga die nog kuisen. Muntjak_DMOGG.csv

SanderDevisscher commented 8 months ago

Here's the cleaned data:

Muntiacus_reveesi_culling.csv

This dataset contains muntjacs shot in flanders & reported at ANB e-loket. Possibly in the future we'll have management from different sources, should I add a source column ?

SanderDevisscher commented 8 months ago

@Yingjie-ZhangOA @mvarewyck I would like to put this page on ice until the portal has been published or we, INBO, have secured some more finances.