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JSK perception ROS packages
https://github.com/jsk-ros-pkg/jsk_recognition
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Kinfuを実行しようとするとFailed to load nodelet [/kinfu]になる #2828

Open Kanazawanaoaki opened 7 months ago

Kanazawanaoaki commented 7 months ago

https://github.com/jsk-ros-pkg/jsk_recognition/issues/2827 に示すようにInstall PCL from source with CUDAの手順を行い，jsk_recognitionをbuildした後，

roslaunch jsk_pcl_ros sample_kinfu.launch

のサンプルを実行すると以下のエラーが発生してkinfuのプロセスが死んでしまいました．

process[kinfu-24]: started with pid [1121253]
type is jsk_pcl/Kinfu
[ERROR] [1713681488.335802289]: Skipped loading plugin with error: XML Document '/opt/ros/noetic/share/prosilica_camera/plugins/nodelet_plugins.xml' has no Root Element. This likely means the XML is malformed or missing..
[ERROR] [1713681488.398246717]: Skipped loading plugin with error: XML Document '/opt/ros/noetic/share/prosilica_camera/plugins/nodelet_plugins.xml' has no Root Element. This likely means the XML is malformed or missing..
[ERROR] [1713681488.712618028, 1498131092.821610080]: Skipped loading plugin with error: XML Document '/opt/ros/noetic/share/prosilica_camera/plugins/nodelet_plugins.xml' has no Root Element. This likely means the XML is malformed or missing..
[ERROR] [1713681488.714973268, 1498131092.821610080]: Failed to load nodelet [/kinfu] of type [jsk_pcl/Kinfu] even after refreshing the cache: MultiLibraryClassLoader: Could not create object of class type jsk_pcl_ros::Kinfu as no factory exists for it. Make sure that the library exists and was explicitly loaded through MultiLibraryClassLoader::loadLibrary()
[ERROR] [1713681488.714992792, 1498131092.821610080]: The error before refreshing the cache was: MultiLibraryClassLoader: Could not create object of class type jsk_pcl_ros::Kinfu as no factory exists for it. Make sure that the library exists and was explicitly loaded through MultiLibraryClassLoader::loadLibrary()
[kinfu-24] process has died [pid 1121253, exit code 255, cmd /opt/ros/noetic/lib/nodelet/nodelet standalone jsk_pcl/Kinfu ~input/camera_info:=/camera/depth_registered/camera_info ~input/depth:=/camera/depth_registered/hw_registered/image_rect_raw ~input/color:=/camera/rgb/image_rect_color __name:=kinfu __log:=/home/kanazawa/.ros/log/b66322fc-ffa9-11ee-a86a-79b99c0bb4cb/kinfu-24.log].
log file: /home/kanazawa/.ros/log/b66322fc-ffa9-11ee-a86a-79b99c0bb4cb/kinfu-24*.log

エラーメッセージ的にはhttps://github.com/jsk-ros-pkg/jsk_recognition/issues/1482 や https://sourceforge.net/p/jsk-ros-pkg/tickets/119/ が近そうですがよくわかりません．

https://answers.ros.org/question/110316/pluginception-build-factory/ を見るとライブラリのリンクが関係しそうなので，build周りを確認していると， build時にPCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_FOUNDの変数がtrue?になっておらず https://github.com/jsk-ros-pkg/jsk_recognition/blob/908748677833a22832c1934e367ef32e4b79912e/jsk_pcl_ros/CMakeLists.txt#L422-L426 辺りの処理が行われていないのが原因のように思います．　　 この変数やPCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARYやPCL_GPU_CONTAINERS_LIBRAR辺りの変数はbuild時に手動で指定する必要があるのでしょうか？　　 あるいはインストールの手順が間違っているor不足しているのでしょうか？

mqcmd196 commented 7 months ago

PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY は少なくとも

https://github.com/jsk-ros-pkg/jsk_recognition/blob/908748677833a22832c1934e367ef32e4b79912e/jsk_pcl_ros/CMakeLists.txt#L66C35-L66C56

ここでセットされるはずです．QUIET を消して，CMakeの出力を教えてもらえますか？

Kanazawanaoaki commented 7 months ago

ありがとう，とりあえず実行したlogを貼っておきます． https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/2bd923abbd818b9470805bde0b8df12e#file-kinfu_debug_catkin_log_20240421-log

その部分の後ろに

# Function to check if a variable is defined and print its value if defined
function(print_if_defined variable_name)
    if(DEFINED ${variable_name})
        message("${variable_name} is defined and its value is ${${variable_name}}.")
    else()
        message("${variable_name} is not defined.")
    endif()
endfunction()

print_if_defined(PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_FOUND)
print_if_defined(PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY)
print_if_defined(PCL_GPU_CONTAINERS_LIBRARY)

を追加したら

PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_FOUND is defined and its value is FALSE.
PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY is defined and its value is PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY-NOTFOUND.
PCL_GPU_CONTAINERS_LIBRARY is not defined.

になっていたので，セットはされているけど無しでセットされているみたいですね．

mqcmd196 commented 7 months ago

なるほど，ということはPCLのソースビルドが出来ていないか，ビルドしたがそこに適切にPATHが通っていない可能性が高いです． ただ#2827 を見る感じ，1.9.0でビルドそのものは出来ているっぽいかな

あとCMakeの出力が見たかったので catkin bt --verbose の結果がほしかったです．

とりあえず送ってくれたログを見ると https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/2bd923abbd818b9470805bde0b8df12e#file-kinfu_debug_catkin_log_20240421-log-L737

で /usr/include/pcl-1.10 を見にいっていて，ソースビルドしたPCLを見にいっていない気がするので，シェルを立ち上げ直すなり，CMAKE_PREFIX_PATHを新たに設定するなりする必要があると思いますが，/usr/local 以下は標準で見る気がする

catkin clean jsk_pcl_ros して catkin build --force-cmake jsk_pcl_ros --verbose

のログを見せてください

2024年4月21日(日) 18:17 Naoaki Kanazawa @.***>:

ありがとう，とりあえず実行したlogを貼っておきます．

https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/2bd923abbd818b9470805bde0b8df12e#file-kinfu_debug_catkin_log_20240421-log

その部分の後ろに

Function to check if a variable is defined and print its value if definedfunction(print_if_defined variable_name)

if(DEFINED ${variable_name})
    message("${variable_name} is defined and its value is ${${variable_name}}.")
else()
    message("${variable_name} is not defined.")
endif()endfunction()

print_if_defined(PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_FOUND) print_if_defined(PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY) print_if_defined(PCL_GPU_CONTAINERS_LIBRARY)

を追加したら

PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_FOUND is defined and its value is FALSE. PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY is defined and its value is PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY-NOTFOUND. PCL_GPU_CONTAINERS_LIBRARY is not defined.

になっていたので，セットはされているけど無しでセットされているみたいですね．

— Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/jsk-ros-pkg/jsk_recognition/issues/2828#issuecomment-2067973455, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AGUARFHBLMHJIIAREMRJF53Y6N72TAVCNFSM6AAAAABGREXARGVHI2DSMVQWIX3LMV43OSLTON2WKQ3PNVWWK3TUHMZDANRXHE3TGNBVGU . You are receiving this because you commented.Message ID: @.***>

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Yoshiki Obinata The University of Tokyo Graduate School of Information Science and Technology Department of Mechano Informatics 2nd grade Ph.D course student JSK Robotics Laboratory

Kanazawanaoaki commented 7 months ago

すみません，なるほどです．

シェルを立ち上げ直して，実行しました． 長すぎて途中からのログと，実行し直した際の途中のログのみですが， https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/84c04b128b68c8c45616b795a2457702#file-kinfu_debug_catkin_verbose_log_v2_20240421-log-L19

CMake Deprecation Warning at /usr/local/share/pcl-1.9/PCLConfig.cmake:42 (cmake_policy):

で1.9の方を見ていそうなのと， https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/84c04b128b68c8c45616b795a2457702#file-kinfu_debug_catkin_verbose_log_v2_20240421-log-L31-L48 の辺りで，

-- Could NOT find PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE (missing: PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_INCLUDE_DIR)

でPCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALEは見つけられてなさそうです．

Kinfuのノードも最初と同じエラーで落ちました．

mqcmd196 commented 7 months ago

ごめん，序盤のログが一番見たかったです． workspaceをsourceして

roscd jsk_pcl_ros
mkdir build && cd build
cmake ..

の実行結果を教えてください

2024年4月21日(日) 19:21 Naoaki Kanazawa @.***>:

すみません，なるほどです．

シェルを立ち上げ直して，実行しました． 長すぎて途中からのログ https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/2bd923abbd818b9470805bde0b8df12e#file-kinfu_debug_catkin_verbose_log_20240421-log%E3%80%80 と，実行し直した際の途中のログ https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/84c04b128b68c8c45616b795a2457702#file-kinfu_debug_catkin_verbose_log_v2_20240421-log のみですが，

https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/84c04b128b68c8c45616b795a2457702#file-kinfu_debug_catkin_verbose_log_v2_20240421-log-L19

CMake Deprecation Warning at /usr/local/share/pcl-1.9/PCLConfig.cmake:42 (cmake_policy):

で1.9の方を見ていそうなのと，

https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/84c04b128b68c8c45616b795a2457702#file-kinfu_debug_catkin_verbose_log_v2_20240421-log-L31-L48 の辺りで，

-- Could NOT find PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE (missing: PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_INCLUDE_DIR)

でPCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALEは見つけられてなさそうです．

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Yoshiki Obinata The University of Tokyo Graduate School of Information Science and Technology Department of Mechano Informatics 2nd grade Ph.D course student JSK Robotics Laboratory

mqcmd196 commented 7 months ago

-- Could NOT find PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE (missing: PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_INCLUDE_DIR)

たしかに見つかってなさそうですね

2024年4月21日(日) 19:26 Yoshiki Obinata @.***>:

ごめん，序盤のログが一番見たかったです． workspaceをsourceして

roscd jsk_pcl_ros
mkdir build && cd build
cmake ..

の実行結果を教えてください

2024年4月21日(日) 19:21 Naoaki Kanazawa @.***>:

すみません，なるほどです．

シェルを立ち上げ直して，実行しました． 長すぎて途中からのログ https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/2bd923abbd818b9470805bde0b8df12e#file-kinfu_debug_catkin_verbose_log_20240421-log%E3%80%80 と，実行し直した際の途中のログ https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/84c04b128b68c8c45616b795a2457702#file-kinfu_debug_catkin_verbose_log_v2_20240421-log のみですが，

https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/84c04b128b68c8c45616b795a2457702#file-kinfu_debug_catkin_verbose_log_v2_20240421-log-L19

CMake Deprecation Warning at /usr/local/share/pcl-1.9/PCLConfig.cmake:42 (cmake_policy):

で1.9の方を見ていそうなのと，

https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/84c04b128b68c8c45616b795a2457702#file-kinfu_debug_catkin_verbose_log_v2_20240421-log-L31-L48 の辺りで，

-- Could NOT find PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE (missing: PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_INCLUDE_DIR)

でPCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALEは見つけられてなさそうです．

— Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/jsk-ros-pkg/jsk_recognition/issues/2828#issuecomment-2067992884, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AGUARFCWGWDYIOAONHWCZ5TY6OHLXAVCNFSM6AAAAABGREXARGVHI2DSMVQWIX3LMV43OSLTON2WKQ3PNVWWK3TUHMZDANRXHE4TEOBYGQ . You are receiving this because you commented.Message ID: @.***>

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Yoshiki Obinata The University of Tokyo Graduate School of Information Science and Technology Department of Mechano Informatics 2nd grade Ph.D course student JSK Robotics Laboratory

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Yoshiki Obinata The University of Tokyo Graduate School of Information Science and Technology Department of Mechano Informatics 2nd grade Ph.D course student JSK Robotics Laboratory

Kanazawanaoaki commented 7 months ago

https://github.com/jsk-ros-pkg/jsk_recognition/issues/2827#issuecomment-2067988063 を参考に，1.10.0のものでbuildし直して実行したログです． https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/d2ef0974827c5bbde843f52d4a1276c6#file-20240421_1947_cmake_log-log

-- Could NOT find PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE (missing: PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_LIBRARY PCL_GPU_KINFU_LARGE_SCALE_INCLUDE_DIR)

でやはり見つかっていなさそうです．．．

mqcmd196 commented 7 months ago

PCLのビルドのときにCUDAアリでビルドされているか見てほしいのですが，-DCUDA=ON とかすると https://github.com/PointCloudLibrary/pcl/blob/pcl-1.10.0/CMakeLists.txt#L366 が呼ばれることになっていて， https://github.com/PointCloudLibrary/pcl/blob/pcl-1.10.0/cmake/pcl_find_cuda.cmake を見ると，-DCUDA=ON だが，CUDAが見つからないときも，特にエラーでコケることなく，そのままビルドが続行されていそうですね．

なのでPCLをビルドするときのCMakeコマンドのログをください

Kanazawanaoaki commented 7 months ago

遅くなりすみません． これは今実行したログですが， https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/6d2237067d5986516c8317407c78514a#file-pcl_cmake_log_20240422-log 最初に1.10.0のPCLをbuildしたときも以下のようなログが出ていたのでCUDAは見つかっているとは思います．

-- Found CUDA Toolkit v10.1
Kanazawanaoaki commented 7 months ago

https://github.com/PointCloudLibrary/pcl/issues/466#issuecomment-33262303 などのログと比較すると， https://gist.github.com/Kanazawanaoaki/6d2237067d5986516c8317407c78514a#file-pcl_cmake_log_20240422-log-L181-L208 ここに

--   gpu_kinfu
--   gpu_kinfu_large_scale

とかが無いのが問題のようで，やはりPCLのBuildでうまくいっていないみたいです．

(追記)このgpu_kinfu_large_scaleが生成されない問題の原因は https://github.com/PointCloudLibrary/pcl/blob/pcl-1.10.0/gpu/CMakeLists.txt#L5-L7 のBUILD_GPU がONである必要があり，自分の場合は

cmake .. -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -DWITH_CUDA:BOOL=ON -DBUILD_GPU=ON

PCLのcmake時にこのように-DBUILD_GPU=ONオプションを付けて実行するとgpu_kinfu_large_scaleもgpu_kinfuもThe following subsystems will be builtのリストの中に入りました．

Kanazawanaoaki commented 7 months ago

その後

cd
wget https://github.com/PointCloudLibrary/pcl/archive/pcl-1.10.0.tar.gz
tar xvzf pcl-1.10.0.tar.gz
cd pcl-pcl-1.10.0
mkdir build
cd build
cmake .. -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -DWITH_CUDA:BOOL=ON -DBUILD_GPU=ON
make -j 4
sudo make install

のmake -j 4の手順で

#error -- unsupported GNU version! gcc versions later than 8 are not supported!

のエラーが出たので，https://qiita.com/PinappleHunter/items/d07ee6f96cf60959b635 , https://linuxize.com/post/how-to-install-gcc-on-ubuntu-20-04/#installing-multiple-gcc-versions を参考にgcc 8を使ってcmakeとmakeを実行．

In file included from /home/kanazawa/pcl-pcl-1.10.0/gpu/kinfu/tools/evaluation.cpp:37:
/home/kanazawa/pcl-pcl-1.10.0/gpu/kinfu/tools/evaluation.h:53:15: error: ‘shared_ptr’ does not name a type; did you mean ‘char16_t’?
   using Ptr = shared_ptr<Evaluation>;
               ^~~~~~~~~~
               char16_t

のエラーが出てmakeできなくなりました． https://github.com/PointCloudLibrary/pcl/issues/5836 によると，sudo apt remove libpcl*で解決するらしいが，そうすると大量のpcl依存のパッケージがアンインストールされるので他の回避策を模索中です．