Rewritten version of paired_read_merger

[egor-bogomolov]

Переписанная версия paired_read_merger'a. Добавлена возможность передать параметры в командной строке, но в связи с этим изменился вызов (принимает полноценную командную строку, а не три названия файлов. Появилась возможность читать риды из нескольких файлов.