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DeepGraphGO: graph neural network for large-scale, multispecies protein function prediction
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请问初始蛋白质的特征是某个物种所有蛋白质的初始特征吗? #13

Closed binggkuoluo closed 2 years ago

binggkuoluo commented 2 years ago

您好!现有以下问题,希望您能帮我解答,感激不尽!

1、请问您数据中给出的蛋白质的特征是包括某个物种有的全部蛋白质的特征吗?比如说9606[Homo sapiens]有很多的蛋白质,那么是给出了9606所含的所有蛋白质的特征吗?您的read me 上只写了给出了 ppi_pid_list.txt里用到的蛋白质,没有说是哪些物种,如果数据里含有某物种的全部蛋白质特征的话,能方便告诉我是哪些物种吗?万分感谢!!

2、请问蛋白质的特征对应的蛋白质ID是跟 ppi_pid_list.txt里蛋白质ID的顺序一致吗?也就是说ppi_interpro.npz里的第一个蛋白质特征对应的是 ppi_pid_list.txt里的第一个蛋白质ID吗?

敬盼您的回复!